La etiqueta de polihistidina es la etiqueta de afinidad de proteínas más utilizada. Debido a su pequeño tamaño de solo seis aminoácidos, rara vez interfiere con la función de la proteína. Además, su baja inmunogenicidad y versatilidad en condiciones nativas y desnaturalizantes destacan esta etiqueta de proteína entre otras. El principio de purificación subyacente de la etiqueta His es una interacción entre los iones metálicos y el anillo de imidazol de la histidina.